6月21日上午，第20期集团前沿论坛在农业微生物资源发掘与利用全国重点实验室六楼报告厅举行。复旦大学生物医学研究院/复旦大学附属儿科医院杨立研究员，为师生带来了以“精确的基因组编辑技术”为主题的报告，本期论坛由新莆京app电子游戏何春江教授主持。
会上，杨力研究员以生动幽默的风格为大家讲述了课题组的研究结果。他首先讲述了利用高通量测序来探索转录组的复杂性，讲述了如何关注到非编码RNA以及发表第一个环状RNA计算分析流程CIRCexplore，成阐述了鉴定环状RNA的金标准。随后开发了升级版的CIRCexplorer2开源工具包，通过比较对应环形RNA和线性RNA的表达，全面阐述了环形RNA可变反向剪接和可变剪接的复杂性和多样性，并建立了环形RNA数据库网站CIRCpeida。近期又开发了可用于环形RNA与线形RNA直接定量比较的CIRCexplorer3.0版本。报告中段，杨立研究员分享了在单基因编辑技术方面，如A-to-I,C-to-U等研究成果。最后，杨立研究员分享了其团队近期利用机器学习，深度学习方法在RNA亚细胞定位研究中的进度，通过比较LightGBM,SVM,Logistic Regression的机器学习模型以及CNN,RNN,CNN+RNN的深度学习模型后，选择使用LightGBM模型来做RNA亚细胞定位分析，并将其命名为RNAlight。
会议最后，杨力研究员与现场师生就环状RNA功能，CRISPR/Cas9等方面进行了热烈的讨论与交流。
【人物简介】杨立，复旦大学生物医学研究院/复旦大学附属儿科医院研究员、研究组组长，长期从事基因组计算生物学及基因编辑前言技术创新体系研究。围绕外显子环状RNA生成加工和功能作用新机制、碱基编辑和修饰互作及调控网络、高效基因组碱基编辑新体系开发和应用等前沿领域开展合作研究，取得了一些列重要原创成果。
